为加快实施广州城市发展“东进”战略，发挥开发区的辐射带动作用，统筹城乡发展，2005年4月，经国务院批准，在广州开发区基础上，整合周边农村地区，设立萝岗区，管辖面积393.22平方公里。下辖夏港街、萝岗街、东区街、联和街、永和街、九龙镇5街1镇，共30个居委会、28个村委会。截至2010年11月1日，全区常住人口37.37万人。
2009年9月，萝岗区政府搬迁正式获得国务院的批复，区政府驻地从萝岗区志诚大道303号搬迁至香雪三路1号区行政服务中心。